Organami Centrum są:1) Dyrektor Centrum, zwany dalej "Dyrektorem"; 2) Rada Centrum, zwana dalej "Radą"; 3) Komitet Sterujący do spraw badań naukowych i prac rozwojowych w obszarze bezpieczeństwa i obronności państwa, zwany dalej "Komitetem Sterującym".