1)
wydaje wytyczne dotyczące funkcjonowania systemu wdrażania funduszy strukturalnych w zakresie zarządzania programami operacyjnymi, sprawozdawczości, kwalifikowalności wydatków, monitorowania procesu wdrażania funduszy, skierowane do instytucji uczestniczących w realizacji Planu, w celu zachowania jednolitości zasad wdrażania Planu;
2)
wydaje w porozumieniu z instytucją płatniczą wytyczne dotyczące funkcjonowania kontroli finansowej i organizacji przepływów finansowych;
3)
organizuje prace Komitetu Monitorującego, o którym mowa w art. 39 Komitet Monitorujący Plan ust. 1;
4)
sporządza sprawozdania z postępów wdrażania funduszy strukturalnych dla Komisji Europejskiej oraz właściwych organów i instytucji;
5)
negocjuje z Komisją Europejską ewentualne zmiany Podstaw Wsparcia Wspólnoty;
6)
koordynuje politykę informacyjną i promocyjną w obszarze funduszy strukturalnych oraz strategii wykorzystania Funduszu Spójności;
7)
organizuje i koordynuje proces ewaluacji Podstaw Wsparcia Wspólnoty.