Minister właściwy do spraw rozwoju regionalnego określi, w drodze rozporządzenia, tryb przeprowadzania kontroli, o których mowa w art. 52 kontrola projektów realizowanych w ramach programu operacyjnego lub strategii wykorzystania Funduszu Spójności i art. 53 kontrola instytucji pośredniczących i wdrażających, mając na uwadze potrzebę zapewnienia prawidłowego wydatkowania środków z funduszy strukturalnych i Funduszu Spójności.