W zakresie nieuregulowanym w ustawie do opłat sankcyjnych stosuje się przepisy ustawy z dnia 14 czerwca 1960 r. – Kodeks postępowania administracyjnego, z tym że w sprawach o nałożenie opłaty sankcyjnej, o której mowa w art. 75a opłata sankcyjna za przywożenie z państw trzecich środków ochrony roślin i pobieranie kaucji ust. 1, nie stosuje się przepisów art. 10 zasada czynnego udziału stron w postępowaniu, art. 107 elementy decyzji § 1 pkt 6 w części dotyczącej uzasadnienia prawnego i art. 138 decyzje organu odwoławczego § 2.